En un inicio se diseñó como el “Futuro original” del Universo Marvel convencional, de la Tierra 616, pero finalmente se consideró un futuro alternativo conocido como Tierra 928.  La historia está compuesta por varios arcos argumentales desarrollados en varios comics como Spiderman 2099, Hulk 2099, X-men 2099, X-Nation 2099, Doom 2099, Castigador 2099 , Motorista Fantasma 2099 y Cuatro Fantásticos 2099. El argumento de este “mundo del mañana” puede resumirse en:

El mundo que conocimos ha quedado devastado por inundaciones globales cuando las capas de hielo de los polos se derritieron y el 90% de la población mundial falleció. Los héroes y los humanos supervivientes se refugiaron en la Tierra Salvaje, Latveria o el grandes arcas.

Ben Grimm alias La Cosa, lideró una expedición a Marte junto con miembros de X-Nation (un derivado de los X-men), para evaluar si era posible evacuar la Tierra. Mientras, la Hechicera Suprema del planeta, Mlle Extraño combate con Garokk (el hombre petrificante) bajo la superficie de la Tierra Salvaje. Uproar y Wulff, dos miembros mutantes de X-Nation se ven envueltos en la gran batalla dentro derrotando una nave pirata capitaneada por el Buitre.

Los X-men del 2099 siguen intentando construir una comunidad de humanos y mutantes unidos, Los Cuatro Fantásticos se desviven por salvar todas las vidas que pueden, por intentar reconstruir la civilización y por regresar a otro tiempo al que pertenecen y  Spiderman llega a entablar una tensa alianza con el Dr. Doom para evitar que la Tierra sea transformada por un Virus Tecnorgánico.

En este mundo de futuro apocalíptico del 2099 también aparecen Hulk, Daredevil (Samuel Fisk), la Pantera Negra, el Mutante 2099 (Chad Channing), el Castigador o los Inhumanos.

Todos estos arcos argumentales se cruzan cuando Falange, el enemigo alienígena del los x-men llega a la Tierra. Finalmente para acabar con la invasión, el Dr. Doom se sacrifica mientras que la atmósfera terrestre es reforzada por aborígenes marcianos para destruir a Falange en órbita. Nostromo (de X-Nation) se convierte en el heredero de Latveria y Spiderman se va en busca de Gabe, su hermano desaparecido. La serie finalizaría después de sólo ocho números.

El patinazo más gordo es que la Cosa no vuelve a ser vista desde el número 1 y  no se sabe si su misión llega o no a tener éxito, además el resto de los Fantásticos regresa a su tiempo sin él. Cabe suponer que su misión en Marte acabó en su fallecimiento y de ahí que no vuelva a aparecer.

Extrañamente, la última página del número final en vez de terminar con los arcos argumentales introducidos (como la batalla de Dra. Extraño y Garokk) dejan abierto un misterio que rodea la resurreción del Motorista Fantasma 2099. Ésto sugiere que la cancelación de la serie fue de repente e inesperada para el equipo creativo.

El Nido se alió con la renegada Shi’ar Ave de Muerte para expulsar a su hermana Lilandra del trono. Como fianza de su lealtad hacia el Nido, Ave de Muerte les da a Lilandra, a los X-men y a su amiga humana Carol Danvers (que fue Ms. Marvel hasta que Pícara le robó los poderes) y a Colmillo de la Guardia Imperial para que los usen como anfitriones. Por supuesto, el Nido hace uso de ellos e implanta un embrión en cada uno excepto en Carol Danvers a la que se llevaron para experimentar con su ADN medio humano medio Kree. El Nido crea una ilusión en la que los héroes y sus amigos creen que están invitados en el Imperio Shi’ar, para que no se den cuenta de que están implantados. Tormenta al darse cuenta que lleva un embrión decide suicidarse pero es salvado por uno de los Acanti. Sin embargo, el factor curativo de Lobezno le libra de su embrión y ayuda a escapar a sus amigos, pero desafortunadamente le es imposible salvar a Colmillo que se transforma en un miembro del Nido antes de escapar.

La Reina del Nido ordena a sus fuerzas encontrarlos hasta que ella misma puede ponerse en contacto con el embrión de una Reina que ha sido implantado en Cíclope de los X-men; le dice que los X-men están volviendo a MundoNido. Resignados a la suerte que les espera, deciden realizar al menos un acto bueno antes de morir ayudando a los Acanti a recuperar el “Alma Racial“, aparentemente una fuerza sobrenatural que debe pasar el líder Acanti a la siguiente generación. El Alma fue localizada en una parte cristalizada de un cerebro de un Acanti muerto. La Reina va con sus lacayos a este área y se pone a luchar contra los X-men, pero inevitablemente éstos empiezan a transformarse en miembros del Nido. La ayuda del dragón alienígena más tarde conocido como Lockheed, les viene bien pero no logra cambiar el curso de la batalla, el Alma ya está casi infectada con la maldad del Nido. No viendo otra solución, Lobezno pide clemencia y decide matar a sus compañeros de los X-men antes de que se transformen totalmente en miembros del Nido. Pero aparece en escena Carol Danvers que ahora se hace llamar Binaria y que gracias a los experimentos que el Nido ha hecho en ella ha obtenido poderes cósmicos; con su llegada logra salvar el Alma de los Acanti. Antes de regresar a donde pertenece, el Alma cura a Lilandra y a los X-men y convierte a la reina en una estatua de cristal. También causa que MundoNido explote, pero los X-men, Lilandra y Lockheed logran escapar con vida. También algunos miembros del Nido logran escapar de la explosión del planeta. Pero no todo fueron alegrías ya que de regreso descubrieron que Charles Xavier havía sido inoculado con un embrión y amenazaba con eclsionar convirtiendo al mayor telépata de la Tierra en un eslizoide. Una vez ya en la Tierra hubierdo de destruir el cuerpo de Charles para librarle del embrión, pero gracias a la tecnología de sus amigos, los Saqueadores Estelares, clonaron el cuerpo del profesor y éste consiguió sobrevivir.

El siguiente encuentro con se produjo cuando un tiburón espacial, una especie extraterrestre similar a los Acanti, se estrelló en la Tierra y los eslizoides diezmaron a los humanos cercanos dejando sólo con vida a un paramédico. A este hombre (Harry Palmer) se le dio la función de encontrar anfitriones, especialmente mutantes, gente con poderes o con posiblidad de tenerlos en un futuro. Su intención era crear un grupo de eslizoides con poderes mutantes capaz de enfrentarse a la los X-men. Atraídos por el Nido los X-men se enzarzan en una batalla con ellos. Mientras, Josey Thomas, un miembro del Nido, inocula a la mujer llamada Hannah Connover, la esposa del reverendo William Connover con el huevo de la Reina que ella misma portaba. Sus manos se curaron de artritis y Hannah usó el Ministerio del Día Sagrado de su marido para inocular a las personas, que atraídas por el milagro de la curacion de sus manos, venían buscando su curación. Tal vez, la fe de de Hannah en el Señor hizo que se resisitiera a la voluntad de la Emperatriz de MundoNido, quien envió a los Primogénitos para que exterminaran a la camada de Hannah, ya que no podía tolerar la insurrección de una Reina. Los Primogénitos combatieron a los X-men y a la prole de Hannah pero su poder era demaiado grande. Como solución el Hombre de Hielo congeló a Hannha según instrucciones de la Bestia, de tal forma que los Primogénitos creyeron que había muerto y se suicidaron dando por terminada su misión.

El Nido volvió a hacer acto de presencia en Nueva Orleans, Belladona Bordreaux, la mujer de Gámbito, avisó a los X-men de que el Nido había secuestrado a los hijos del Clan de los Asesinos para usarlos como anfitriones. Los mutantes contaron con la ayuda del Motorista Fantasma, el cual fue capturado e inoculado con un embrión; pero gracias al origen sobrenatural de sus poderes pudo deshacerse del embrión antes de que le controlara. Finalmente el Nido fue derrotado y expulsado de Nueva Orleans. Meses más tarde, una Reina superviviente intentó obligar a el Motorista Fantasma, Lobezno y Gámbito para que fueran anfitriones a cambio de la vida de un grupo de rehenes, pero los héroes lograron evitarlo.

Años después, un grupo de héroes de la Tierra son invitados por una aparentemente benevolente raza alienígena a participar en una serie de combates amistosos con el fin de intercambiar tecnología. Sin embargo, se trataba de el Nido que pretendía usar a Pícara, a quien infectó con el embrión de una Reina, a absorber el poder del resto de los héroes y así convertir al Nido en imparable. Pero Ironman dándose cuenta de que el Nido estaba detrás de ellos, organiza una rebelión contra ellos. Carol Danvers y Kitty Pryde también habían acudido al “concurso” pero la fisiología kree de Carol y los poderes de intangibilidad de Kitty les previno de ser usadas como anfitriones. A pesar de que la Reina ya había obtenido los poderes de el Capitán América, Thor, Hulk, Spider-Man, Jean Grey y la Bruja Escarlata, consiguen derrotarla. El embrión de la Reina que había sido implantado en Pícara fue consecuentemente extraído con la ayuda de Carol Danvers, forzando a la Reina a extraerlo amenazando con matar a Pícara.

Más tarde el Nido regresa a a Tierra y los X-men unieron fuerzas con los 4 Fantásticos y les obligaron a huir haciéndoles creer que Galactus y la Fuerza Fénix habían regresado a la Tierra. Todo ello lo consiguieron con una versión mejorada de Cerebro.

De nuevo atacaron la Tierra y es combatido por Carol Danvers quien había jugado un papel clave en su primera derrota. Extarañamente el Nido no reconoció a Carol a pesar de que habían experimentado con ella en el pasado. Eso es debido porque bajo el aspecto de Binaria sus poderes cósmicos cambiaban su aspecto físico.

Durante el arco argumental de Annihilus, se especula que ha destruido casi en sus totalidad al Nido, dejando unos pocos supervivientes.

De acuerdo con el viajero en el tiempo Bishop habrá facciones benignas del Nido en el futuro y se especula que Hannah Connover puede ser el origen.

Al final de “Atracciones Fatales“, Magneto le arrancaba el adamantium de los huesos a Lobezno provocando la ira del Profesor Xavier borrándole le mente. Sin saberlo había absorbido la oscuridad de su antiguo amigo; las emociones negativas, unidas con los impulsos reprimidos de Xavier, crea a un poderoso ente psiónico que se hace llamar Onslaught.

El personaje de Onslaught aparece como referencia por primera vez cuando una sombra difusa con los colores y el diseño de éste aparece habando con una aterroirzada Mística.

Su nombre se menciona por primera vez cuando el Juggernaut se estrella Hoboken, New Jersey, habiendo sido golpeado lo suficientemente fuerte por Onslaught para enviarlo a través del país.

Hace plena aparación cuando el personaje se pone en contacto con Jean Grey en el plano astral.

Onslaught encarcela al Juggernaut dentro del rubí de Cyttorak y derrota a los X-men. Onslaught pretende destruir a todos los humanos y los mutantes y secuestra a Franklin Richards (el hijo de Mr. Fantástico y la Mujer Invisible) y a Nate Grey (hijo de Cíclope y Jean Grey en el universo paralelo de la Era de Apocalipsis). Usando sus poderes psiónicos para incrementar el suyo propio, cambia también su aspecto físico.

Onslaught combate a Los Vengadores, Los 4 Fantásticos, a los X-men y a Hulk. A este último le es posible destruir la armadura psíquica de Onslaught. Sin embargo, muchos de los héroes no mutantes, incluyendo a la Bruja Escarlata y a Bruce Banner (físicamente separado de Hulk), sacrifican su vida para destruir la coraza de Onslaught desde dentro, debilitándolo, y permitiendo a los X-men destruirle.

Gracias a los ilimitados poderes de Franklin Richards, los Vengadores, los 4 Fantásticos y Bruce Banner no mueren sino que renacen en una “dimensión de bolsillo” creada por el chiquillo. En este universo, durante un caótico acontecimiento que involucra la detonación inminente del núcleo de poder gamma del cuartel de Los Vengadores, Onslaught aparece brevemente bajo una forma no corpórea.

Se trata de un crossover de los X-men y los Vengadores y es una secuela directa de Atracciones Fatales.

Detalla la repercusión del borrado de mente que Xavier le hizo a Magneto. Detalla una guerra civil entre la población humana y mutante de Genosha, incitada por el antiguo protegido de Magneto: Fabián Cortez.

Debido a la incapacitación de Magneto, Cortez intenta escudarse en la ira de su antiguo maestro y secuestra a la nieta de Magneto: Luna. Sin embargo, como Mercurio es el padre de Luna y tiene lazos con los X-men y como su madre es Crystal, una Inhumana miembro de los Vengadores, ambos equipos se ven envueltos en la revuelta Genoshiana. La situación se complicó más cuando Éxodo, el teniente de Magneto y su autoproclamado heredero, buscaba matar a Cortez por su traición y a Luna por la vergüenza para la línea de sangre de Magneto, ya que la niña era meramente humana.

Uno de los efectos más duraderos de “Lazos de Sangre” fue que Los Vengadores dejaron de operar bajo el mandato de las Naciones Unidas.